婴儿扩肛通常3-6个月才能自主排便，但具体时间还要因人而异。扩肛后如果婴儿长时间无法自主排便，还要及时向医生反馈，必要时可以接受规范性治疗，避免病情延误。
扩肛是临床上治疗婴儿肛门闭锁的一种方法，如果婴儿肛门闭锁的程度比较轻微，及时给予扩肛治疗，通常3个月左右，肛门的解剖结构以及功能可以恢复正常，此时婴儿也能够自主的排便。
如果婴儿肛门闭锁的程度比较严重，由于肛门软组织功能受限程度胶严重，因此扩肛治疗时间会有所延长，大概需要6个月左右，才可以恢复自主的排便功能。
日常家长要让婴儿养成良好的排便习惯，尽量固定排便的时间，排便时也要督促其自主排便，不要抱着婴儿。